CellBlender and MCell
MCell Homepage »
MCell4 Reference Manual »
1. Blender Basics
1.1. Starting Blender
1.2. Know What you’re looking at
1.3. Screens
1.4. Areas
1.5. Regions
1.6. Common Shortcuts
1.7. Mesh editing
1.7.1. Mesh basics
1.7.2. Mesh options
1.7.3. Vertex Tools
1.7.4. Edge Tools
1.7.5. Face Tools
1.7.6. Transformation
1.7.7. Duplicating
1.7.8. Subdividing
1.7.9. Clean up
2. Required Software
3. Single Molecule Diffusion
4. Add Simple Mesh Geometry
5. Unimolecular Reactions
6. Bimolecular Reactions
7. Advanced Features
8. Advanced Models
9. Optimizing Your Simulation
10. Mesh Analysis
11. Repairing Meshes
12. CellBlender Examples
13. FAQ
14. Features supported in older versions of MCell
CellBlender and MCell
»
1.
Blender Basics
»
1.7.
Mesh editing
View page source
1.7.
Mesh editing
¶
1.7.1. Mesh basics
1.7.1.1. Translation, Rtoation, Scale
1.7.1.1.1. Transform Panel
1.7.1.1.1.1. Edge Data
1.7.1.2. Adding Geometry
1.7.1.2.1. Duplicate or Extrude to Cursor
1.7.1.2.1.1. Creating Vertices
1.7.1.2.1.2. Creating Faces
1.7.1.3. Deleting and Dissolving
1.7.1.3.1. Delete
1.7.1.3.2. Dissolve & Limited Dissolve
1.7.1.3.2.1. Dissolve
1.7.1.3.2.1.1. Examples
1.7.1.3.2.2. Limited Dissolve
1.7.1.3.3. Edge Collapse
1.7.1.3.4. Edge Loop
1.7.1.3.4.1. Example
1.7.1.4. Make Edge/Face
1.7.1.4.1. Methods
1.7.1.4.1.1. Isolated vertices
1.7.1.4.1.2. Isolated edges
1.7.1.4.1.3. N-gon from edges
1.7.1.4.1.4. Mixed vertices/edges
1.7.1.4.1.5. Edge-Net
1.7.1.4.1.6. Point Cloud
1.7.1.4.1.7. Single Vertex Selection
1.7.2. Mesh options
1.7.2.1. X-Mirror
1.7.2.2. Topology Mirror
1.7.2.2.1. Example
1.7.2.3. Further Options
1.7.3. Vertex Tools
1.7.3.1. Merging
1.7.3.1.1. Merging Vertices
1.7.3.1.2. AutoMerge Editing
1.7.3.1.3. Remove Doubles
1.7.3.2. Separating
1.7.3.2.1. Rip
1.7.3.2.1.1. Examples
1.7.3.2.1.2. Limitations
1.7.3.2.2. Rip Fill
1.7.3.2.3. Split
1.7.3.2.4. Extend Vertices
1.7.3.2.5. Separate
1.7.3.3. Vertex Slide
1.7.3.4. Smooth Vertex
1.7.3.5. Convex Hull
1.7.3.6. Make Vertex Parent
1.7.3.7. Add Hook
1.7.3.8. Blend From Shape, Propagate Shapes
1.7.4. Edge Tools
1.7.4.1. Make Edge/Face
1.7.4.2. Set Edge Attributes
1.7.4.2.1. Mark Seam and Clear Seam
1.7.4.2.2. Mark Sharp and Clear Sharp
1.7.4.2.3. Adjust Bevel Weight
1.7.4.2.4. Edge Crease
1.7.4.3. Edge Slide
1.7.4.3.1. Usage
1.7.4.3.1.1. Even mode
1.7.4.3.1.2. Limitations & Workarounds
1.7.4.4. Rotate Edge
1.7.4.4.1. Using Face Selection
1.7.4.5. Edge Split
1.7.4.6. Bridge Edge Loops
1.7.4.6.1. Examples
1.7.5. Face Tools
1.7.5.1. Make Edge/Face
1.7.5.2. Fill
1.7.5.2.1. Beauty Fill
1.7.5.2.2. Grid Fill
1.7.5.3. Solidify
1.7.5.4. Intersect
1.7.5.4.1. Intersect (Knife)
1.7.5.4.2. Intersect (Boolean)
1.7.5.5. Wireframe
1.7.5.6. Poke Faces
1.7.5.7. Triangulate Faces
1.7.5.8. Triangles to Quads
1.7.5.9. Weld Edges into Faces
1.7.5.10. Rotate Edges
1.7.6. Transformation
1.7.6.1. Mirror
1.7.6.1.1. Axis of Symmetry
1.7.6.1.2. Pivot Point
1.7.6.1.3. Transformation Orientations
1.7.6.1.4. Mirror Vertex Group
1.7.6.2. Shrink Fatten
1.7.7. Duplicating
1.7.7.1. Duplicate
1.7.7.1.1. Duplicate
1.7.7.2. Extrude
1.7.7.2.1. Extrude Region
1.7.7.2.1.1. Details
1.7.7.2.2. Extrude Individual
1.7.7.2.3. Extrude Edges and Vertices Only
1.7.7.2.4. Extrude Repeat Mesh
1.7.7.3. Inset Faces
1.7.7.3.1. Options
1.7.7.4. Spin
1.7.7.4.1. Options
1.7.7.4.2. Example
1.7.7.4.3. Angle
1.7.7.4.4. Dupli
1.7.7.4.5. Merge Duplicates
1.7.7.4.6. Recalculate Normals
1.7.7.5. Screw Tool
1.7.7.5.1. Usage
1.7.7.5.2. Limitations
1.7.7.5.3. Options
1.7.7.5.4. Examples
1.7.7.5.4.1. The Spring example
1.7.7.5.4.2. Clockwise and Counterclockwise using the Spring Example
1.7.7.5.4.3. Bending the Profiles using the Spring Example
1.7.7.5.4.4. Creating perfect Screw Spindles
1.7.7.5.4.5. A Screw Tip
1.7.8. Subdividing
1.7.8.1. Subdivide
1.7.8.1.1. Options
1.7.8.1.2. Examples
1.7.8.1.2.1. One Edge
1.7.8.1.2.2. Two Tri Edges
1.7.8.1.2.3. Two Opposite Quad Edges
1.7.8.1.2.4. Two Adjacent Quad Edges
1.7.8.1.2.5. Three Edges
1.7.8.1.2.6. Tri
1.7.8.1.2.7. Quad/Four Edges
1.7.8.1.2.8. Multicut
1.7.8.1.3. Un-Subdivide
1.7.8.2. Loop Subdivide
1.7.8.2.1. Loop Cut and Slide
1.7.8.2.1.1. Usage
1.7.8.2.1.1.1. Pre-visualizing the Cut
1.7.8.2.1.1.2. Sliding the new Edge Loop
1.7.8.2.1.2. Options
1.7.8.2.1.2.1. Loop Cut
1.7.8.2.1.2.2. Edge Slide
1.7.8.2.2. Offset Edge Slide
1.7.8.3. Vertex Connect
1.7.8.3.1. Connect Vertex Path
1.7.8.3.2. Connect Vertices
1.7.9. Clean up
1.7.9.1. Decimate Geometry
1.7.9.2. Fill Holes
1.7.9.3. Make Planar Faces
1.7.9.4. Split Non-Planar Faces
1.7.9.5. Split Concave Faces
1.7.9.6. Delete Loose Geometry
1.7.9.7. Degenerate Dissolve